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- 软件功能：
- 预测miRNAs的靶基因；
- 预测调控基因的miRNAs；
- 取任意多个数据库预测结果的交集并输出；
- 将gene symbol转换为Req ID；
- 将Req ID转换为gene symbol。
- 采用的数据库版本：
- TargetScan：Release 7.1
- MicroCosm：Version 5.0
- Pictar：（Lall et al 2006）
- miRDB：Version 5.0
- 使用说明
本软件可以方便的完成TargetScan、MicroCosm、Pictar和miRDB靶基因的预测、结果输出和取交集（图2）。
1、预测miRNAs的靶基因
在①中输入miRNAs的列表，勾选使用的数据库，⑤中箭头选择为“→”，点击“预测”按钮。②中显示已完成预测的miRNAs列表，如果完成预测后，在②中没有您输入的miRNAs表示您勾选的数据库中没有该miRNAs的靶基因数据。点击“导出结果”按钮可以导出您输入miRNAs所有的靶基因预测结果。如图2所示，“1”表示miRNA调控对应的基因，而“0”表示不存在调控关系。
您可以通过勾选②中一个或多个miRNAs、选择由几个数据库取交集、点击“变换交集”按钮来取得这些miRNAs靶基因的集合，取交集的结果显示在③中。您也可以导出如图2中的结果后，根据需要求不同数据库对应列的和，然后筛选您想要得到的靶基因交集。
2、预测靶基因的miRNAs
在③中输入靶基因gene symbols的列表，勾选数据库，⑤中箭头选择为“←”，点击“预测”按钮。②中显示已完成预测的gene symbols列表，如果完成预测后，在②中没有您输入的gene symbol表示您勾选的数据库中没有该gene symbol数据。点击“导出结果”按钮也可以导出预测到的miRNAs。
您可以通过勾选②中一个或多个gene symbol、选择由几个数据库取交集、点击“变换交集”按钮来取得这些预测的miRNAs集合，取交集的结果显示在①中。
3、gene symbol和Req ID的转换
③ 中的gene symbol和④中的Req ID可以通过点击“>”和“<”箭头按钮完成相互转换。